Le Lycée Français de Chicago est géré par son Conseil d'administration, garant de la mission éducative et de la santé financière de l'établissement.

La responsabilité du Conseil d'administration est de définir la mission, la vision et les objectifs stratégiques permettant d'assurer la croissance et la réussite du lycée à long terme.

La mise en œuvre pratique des politiques et orientations définies par le Conseil ainsi que l'administration du Lycée au quotidien, y compris l'embauche du personnel enseignant ou administratif, les programmes scolaires, et les politiques pédagogiques sont de la responsabilité du Chef d'établissement, responsable devant le Conseil d'administration.

Le Conseil d'administration et la direction du Lycée s'assurent que les valeurs, les préoccupations, et les attentes des parents et autres parties concernées sont prises en compte dans les décisions stratégiques qui influent sur la qualité de l'éducation dispensée.

A cet effet, les représentants des parents et enseignants au Conseil d'établissement, ainsi que certains membres de l'équipe pédagogique sont régulièrement invités aux réunions du Conseil d'administration qui maintient également un contact permanent avec la communauté des parents par l'intermédiaire du président de l'Association des parents, membre ex-officio du Conseil. Par ailleurs, le Lycée mène régulièrement des enquêtes de satisfaction auprès des membres de la communauté.